🔊 TME Spatial Insights｜腫瘤微環境空間解析專題

AMPIVIEW^® RNA Probes

解析腫瘤微環境 (TME) 的空間異質性

在腫瘤微環境 (Tumor microenvironment, TME) 研究中，傳統RNA原位檢測技術 (ISH/FISH) 雖已廣泛使用，但常受限於靈敏度與穩定性。

Enzo AMPIVIEW^® RNA Probes 為追求高效能的實驗室設計，僅需約 1 個工作天，即可在保留組織完整型態的同時，精準定位 TME 中的核酸分布。讓您不再需要在靈敏度、時間與經費間妥協，輕鬆解析疾病分析中重要的空間異質性 (Spatial heterogeneity)！

即使是低表現量的目標，例如SiHa細胞中僅有 1-3 個 HPV integrated copies，AMPIVIEW^® 仍能提供清晰顯色結果 ( Fig. 1 )，顯示其對低表現量目標的偵測能力；在 Pap smear 樣本中，其檢測靈敏度相近於PCR等級 ( Fig. 2 )。

Fig. 1 Detection of HPV 16/18 in SiHa cells (1-3 HPV integrated copies) with A. AMPIVIEW™ HPV 16/18 sRNA probes to detect viral DNA only and B. AMPIVIEW™ HPV 16/18 antisense RNA probes to detect both viral DNA and viral RNA in cells.

Fig 2. ISH Results with AMPIVIEW® HPV High-Risk RNA Probes are as Sensitive as PCR Results

採用 LoopRNA™ 技術平台，顯著降低非特異性背景訊號。與市售常見品牌相比，在COVID-19肺部組織中，可精準定位，排除巨噬細胞等非特異性干擾，提供更清晰的結果( Fig 3 )¹。

Fig 3. Detection of SARS-CoV-2 RNA in Lung Tissue. A. SARS-CoV-2 detection using a competitor's probe. B. SARS-CoV-2 localization using AMPIVIEW® RNA probes. C. Negative control in normal lung tissue using AMPIVIEW® RNA probes.

AMPIVIEW^® RNA probes可直接在標準光學顯微鏡下觀察單細胞層級的RNA分布，協助分析腫瘤組織中的空間分布與基因表現差異。

▲ 應用實例 | AMPIVIEW^® EGFR (AS) Dig RNA Probes

採用 digoxigenin 標記 antisense probes，在良性攝護腺增生伴隨急性發炎檢體中精確偵測 EGFR RNA 表現，同時完整保留組織空間資訊，特別適用於腫瘤微環境與 spatial biology 研究應用。
Fig 4. EGFR detection in benign prostatic hyperplasia, with acute inflammation specimen with A. AMPIVIEW® EGFR (AS) Dig RNA probes, B. AMPIVIEW® NSP-Dig RNA probes (negative control), C. leading competitor’s EGFR probes, D. leading competitor’s negative control probes.

• 已成功驗證於 Roche Diagnostics DISCOVERY ULTRA 自動化平台，支援高通量與多重標記分析需求
• 可搭配既有 IHC / ISH workflow，進一步整合蛋白與 RNA 表現資訊

AMPIVIEW^® RNA probes已拓展至多種空間生物學與疾病研究領域：

歡迎瀏覽 AMPIVIEW^® RNA Probes 產品頁面或洽詢 伯森專員 了解更多資訊。

參考資料：

1. Nuovo, GJ et al. 2022 App ImmunohistochemMo Morphol