基因晶片與生物資訊分析服務
伯森所提供的【基因晶片與生物資訊分析服務】不僅採用優質新穎的實驗設備與嚴格管控的標準化流程為您進行晶片分析實驗，更透過專業技術人員與分析軟體幫助您取得文獻發表等級的分析數據。歡迎與我們聯繫索取服務詳情。
Agilent Gene Expression Microarray Service
由獲得 Agilent 認證之晶片服務公司 Welgene 所提供的專業晶片實驗分析服務，全程採用 Agilent 原廠建議之設備與實驗方法。有別於一般服務中心，我們能夠提供您詳盡的後續實驗報告講解與生物資訊服務，幫助您快速掌握實驗分析結果。
服務流程
- 聯繫伯森業務專員確認服務內容與費用
- 依循「樣本製備建議」指示準備待測樣本
- 填寫送樣表單，通知伯森業務收取樣本
- 收件後，於三個工作天內將發出樣本品質檢測報告，此時會再次與您確認是否進行後續基因晶片實驗
- 於取得您的同意後，約三週左右將發出晶片實驗報告，並可依照您的需求提供報告講解或生物資訊服務
服務特色
- 僅需 5 µg 以上的 Total RNA 即可提供基因表現晶片實驗分析服務。
- 採用 Agilent 專利噴墨原位合成技術 (in situ inject printing) 的 60 mer Oligo 晶片，比起一般 25 mer 形式晶片靈敏度提高 5~8 倍
晶片種類
8 x 60K (human or mouse) ※歡迎洽詢更多晶片種類資訊，或參閱 Agilent 網站說明
實驗流程說明
Step 1. 製備 Total RNA：依不同樣本形式進行後續處理，最終產物為 Total RNA。
| Total RNA | Cell | Tissue | Blood | |
|---|---|---|---|---|
| 樣本需求量 | ≥5 µg | ≥10⁶ cells | 20 mg | 2.5 ml |
| 樣本處理 | 不需額外處理 | 以 Trizol 結合 spin column 方法純化 Total RNA | 以雷射擷取微組織細胞 (LCM) 的方法擷取特定均質細胞群再純化 Total RNA，或直接純化 Total RNA | 以 Trizol 結合 spin column 方法純化 Total RNA |
| 貯存溫度 | -80°C | -80°C | -80°C | -20°C |
| 運送方式 | 乾冰 | 乾冰 | 乾冰 | 乾冰 |
Step 2. Total RNA 品質檢測
- 採用 NanoDrop 進行 RNA 量、濃度與純度之測量，其靈敏度可達 5 ng/ml，受測體積僅需 1µl。
- 以 Agilent Bioanalyzer 2100 微流體電泳系統搭配 RNA 6000 nano labchip 或 RNA 6000 pico labchip 提供符合國際期刊所需之標準值檢測，包含：28S/18S ratio 以及 RIN (RNA Integrity Number) RNA 完整度測量。
- 需符合下列標準方可進行後續晶片實驗：
☑ RNA amount ≥5 µg
☑ RNA concentration ≥0.2 µg/µl
☑ OD260/OD280 ≥1.8
☑ 28S/18S ratio ≥1.2
☑ RIN ≥7
Step 3. cRNA 放大暨螢光標定反應：將樣本 RNA 合成雙股 cDNA 之後，以 in vitro Transcription 放大合成 cRNA 同時以 Aglient Labeling 系統線性放大反應合成標定有 Cyanine 3-CTP/Cyanine 5-CTP 的 cRNA 樣本 (實驗原理與流程)。
Step 4. 雜交反應：兩種標定的 cRNA 樣本和基因晶片進行約 17 小時之雜交反應 (hybridization)。
Step 5. 數據分析：影像分析及實驗數據結果輸出。
Step 6. 發送報告：實驗分析報告包含下列內容，其中 1~3 項為數位型式，第 4 項則為文件型式。可依需求提供免費報告解說服務。
- 影像檔案
- 基因表現比值 (gene expression ratio)：包含原始數據及比值 >2 或 <0.5 兩種形式
- 基因註解
- Microarray information (MIAME)
